在近未来的上海浦东，高度机械化的前昆仑科技首席科学家白璃，在废弃工业区躲避其前任导师、数字寡头林昆仑的追杀。
三年前的实验室爆炸使她身体60%机械化，并留下了被虚拟意识
“白刃”（源自游戏《九州云》）侵蚀的后遗症。林昆仑推行
“天罗3.0”计划，意图建立抹除个人意识的
“数字佛国”，而白璃与白刃的意识融合是其计划的关键。白璃手持前同事陈默留下的
“倚天”U盘，根据线索启动
“女娲”协议，以对抗林昆仑。在逃亡中，白璃与信息掮客小吴重逢，得知陈默已成为反抗林昆仑的通缉犯。
陈默突然现身，澄清三年前的背叛实为林昆仑操控其复制体所为，并揭示
“起点”协议是对抗
“天罗3.0”的核心密钥。三人遭林昆仑麾下的
“净坛使者”围攻，被迫潜入由洪七领导的
“新丐帮”地下基地——
“量子江湖”。洪七指出，白璃与白刃必须进行风险极高的
“深度意识同步”，才能掌控
“源初代码”的力量，并揭示林昆仑背后可能存在更古老的邪恶力量。白璃与白刃在意识深海成功融合，形成兼具理性与情感、现实与虚拟特质的新意识。
决战日，洪七指挥黑客组与突击组分别干扰林昆仑的舆论宣传并破坏其能源系统，而白璃-白刃则直闯昆仑大厦顶层。
面对已与网络融合的林昆仑，她将自身意识注入核心数据流，在意识深海与具现为黑暗实体的林昆仑展开终极对决。
最终，白璃-白刃以部分意识永困数据深渊为代价，构筑囚笼封印林昆仑，导致
“天罗3.0”崩溃。战后，白璃身体逐渐康复，但意识中仍留有白刃的痕迹。
陈默陪伴其左右，通过404鹦鹉的遗言与城市屏幕上盛放的虚拟桃花，暗示白刃精神的永存。
三十年后，鹦鹉残骸引导新一代少女踏入江湖，而年迈的陈默见证传承后隐退于数据洪流。