中都南遇敌退返，屡战皆败。胡沙虎警之：“再败当斩“后战果败，高琪惧诛。十月十五围杀执中，携首请罪，宣宗赦他，以胡沙虎为左副元帅，回朝将士皆获升赏。宣宗诏示：“胡沙虎久蓄篡逆，庆山奴等屡奏其谋。斜烈泄密于胡鲁，讹出转告高琪，遂于本月诛杀逆臣。特颁此诏以安民心“时论谓高琪专杀，故有此诏。未几高琪擢升平章政事。
宣宗议马政，问高琪：“昔购马西夏，今可行？“答曰：“良马可市，另可征沿边部族马匹“，宣宗担忧沿边马匹不足，高琪奏河南驻军有二万战马。宣宗令妥善饲养训练。贞祐二年十一月宣宗问责劣质军器，高琪推责三部。宣宗命严惩。议杨安儿战事，高琪称已围困待擒，宣宗令速攻防突围
完颜素兰密奏军机，依制屏退左右。此前游茂曾谏高琪权倾朝野，内外皆惧。虑，因而入宫游茂密奏宣宗请制高琪，宣宗拒之。游茂转投高琪称“宰相当守制免疑“高琪疑其曾密奏，上告帝。游茂判死免罪，杖百除名。嗣后密奏皆置近臣监之。素兰密见时，宣宗留赵和和在侧。素兰谏问：“昔削伯德文哥兵权反令统义军，其抗命被赦，此策何人所献？“
素兰奏高琪专权事，言其勾结文哥，私控刘温，欲脱中都节制。帝颔之。素兰复劾高琪本无勋望，昔弑胡沙虎乃自保计。今树党营私，戮言者樊知一，擅任塔不，坏法乱政，实危社稷。望陛下早断。措宣宗与素兰议政，素兰劝其慎重考虑，并嘱保密。
四年十月蒙军破潼关。高嶷上奏陈失战机：河朔败未援、都兵未死战、敌撤未追击。今请命高琪为帅未果。御史台析蒙军分兵围城：以游骑断京道，另攻州县渐困京师。若仅守城，中都之危将再现，今公私积蓄不及中都百分之一，令人寒心。不攻京城而纵兵掠州县如火置心腹。请遣陕兵守潼关，与蒲察阿里不孙成掎角之势，选京中勇将十人各率精兵相机御敌，并传此法于河北。帝命交尚书省，高琪驳：台官素不谙军事。遂止。高琪唯重兵固南京以自保，不顾州郡残破。终致败亡。
未几，高琪晋右丞相，奏：监察官纠弹当依本律。外使私通泄密，宿卫近侍私谒宗亲宰辅者，当依规严惩。受灾缺粮、转运军粮私藏、科举用印不严等罪皆杖刑。在京违犯两次者，御史台官减等赎罪，余仅罚专差者。任期考评时，若漏查应处死案，称职者降为平常，平常者降职。帝准奏。高琪请修南京城，宣宗斥劳民伤财。
初王世安献取盱眙楚州策，枢密院奏任其为招抚使，择智勇者赴淮南招抚红袄军及宋官。宣宗准奏，遣人同行
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