影院里，影迷们都被傻强萌坏了。
无间道前两部里，傻强都是人气配角，但影迷还是没想到，一开始就让他当作一个故事引子出场了，
“我只有你一个手下”，计较这种事情，就像是在脑门儿上写着“我还是傻强”一般提醒观众不要忘了他一直以来的可爱。
伴随着傻强的惨叫和缓缓降落的电梯，无间道第三部的内容，就此拉开帷幕。
若不是《无间道》忠实粉丝，详细知道前面故事的人物剧情，那《无间道3》会把人看懵逼，比如那些听说《无间道》系列很好看很好看，见到《无间道3》上映了直接就进电影院买了张电影票的影迷。
许多影迷即便是之前看了前两部的，现在看第三部，要一遍就搞懂也不容易，故事在时间上，就成了两部分，一部分发生在《无间道1》的故事之前，一部分发生在陈永仁死后十一个月的三天内。
第三部里又出现了新的人物，杨锦荣这个角色的登场，在前面让人根本分辨不出他的正邪，开头就以一个嫁祸人的冷面形象出现，同时还有大陆来的神秘人物沈澄，明面上是个军火商，但总让人摸不透。
故事的第一条时间线，是2002年6月14日韩琛、沈澄、杨锦荣、陈永仁等人为主的交易的事情。这条线从2002年5月陈永仁帮傻强砸店开始，随后6月14日“沈澄”来内地谈生意，期间发生陈永仁打沈亮等事情，沈澄、陈永仁、杨锦荣第一次碰面，然后8月16日陈永仁开始了三个多月的心理治疗期间与李心儿产生爱情；然后是傻强和陈永仁一起到码头谈生意；接着是韩琛与杨锦荣交换情报；这段故事最后就是韩琛让陈永仁送死，陈永仁、沈澄与杨锦荣互相知道身份，一直持续到陈永仁死前七天在音箱店遇到刘建明。
另一条线是2003年11月时刘建明与杨锦荣的互查，从陈永仁死后十天开始。当时的杨锦荣从北京归来，收到了内鬼寄来的录音带，于是知道警察内部仍有内鬼。
同时刘建明初见杨锦荣时就遇到了同样是韩琛派到警察局的内鬼陈俊自杀，知道还没安全，而且感觉到杨锦荣开始怀疑自己了。等刘建明调回内务部后，发现杨锦荣和韩琛有说不清楚的联系，并且和韩琛以前的生意伙伴内地来的军火商沈澄也有莫名的关系。
此时刘建明想的是，要么杨锦荣就是为了找韩琛的卧底，要么也和自己一样也是韩琛的内鬼，无论怎么说，杨锦荣是刘建明最好的目标，因为杨锦荣看起来本身也不干净，所以只要找到证据
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