石时中美签的合同规定，在周口店发掘的所有化石都是中国财产，禁止运送出境。所以当时美国公使馆的人拒绝接收。
后经国民政府协调，远在重庆的美国驻华大使同意并授权，驻北平的美国公使馆才接收这批珍贵的古人类化石，并准备将其安全运往美国保存。
1941年12月5日凌晨，一列美海军陆战队专列驶出北平，按计划列车到秦皇岛后，化石运到“哈利逊总统”号轮船，然后运往美国。
只是很不幸的是，就在海军陆战队准备启程回美国的时候，日本人偷袭了珍珠港，太平洋战争也由此爆发，日军迅速占领了美国在华的机构，美海军陆战队在秦皇岛的兵营也被日军侵占，北京人头盖骨不见了踪迹。
这件事情成为震惊世界的失窃案，半个多世纪以来，人们继续寻找着。
在1998年，北京人之父贾兰坡曾经联合其他十余名院士发起“世纪末的大寻找”，但最后却没有发现任何有价值的线索，至今仍无结果