全部资金，甚至连殖民地最基本的物资供给都不能保证稳定，这使得许多西班牙殖民者聚集起来发动多次叛乱，以反抗哥伦布和殖民地政府的统治，要求更多的好处和权力。
最终，随着叛乱次数和规模的越来越大，以哥伦布为首的殖民地政府为了挽回叛乱者的支持，不得不满足他们的要求，于1498年正式在美洲建立了一种名叫分配制的殖民制度，给予了每个西班牙殖民者许多好处和权力。
这一制度，大抵就可以看做是“委托监护制”的起源和前身。
然而此时出现了一个非常重要的矛盾：西班牙人在美洲早期实行的贡税制和分配制，实际上都是殖民地政府和殖民者们私自实行的，是一种非官方制度。他们根本没有与西班牙朝廷经过任何沟通，就私自瓜分了原属于西班牙国王的土地和臣民，还将印第安人变为了奴隶。
在这个过程中，西班牙朝廷非但没有从中得到任何好处，殖民者奴役印第安人的举措还影响了西班牙朝廷的税收——因为按照西班牙的法律规定，只自由人才有交纳年贡的义务。
因此，以西班牙国王和王室成员为首的西班牙朝廷，与美洲殖民者和殖民政府之间存在着分歧和矛盾，两者虽然都对印第安人实行剥削，但具体的剥削方法和方式有着很大的差异。
西班牙朝廷想通过某种和平的方式，将印第安人变成自己的直属臣民，就如普通西班牙人一样，然后通过政治和经济手段对印第安人进行剥削和统治。
而殖民者则想将印第安人变成自己的私有财产，然后随意奴役、买卖和杀害，或是掠取印第安人所创造的全部劳动成果，并不想与西班牙朝廷分享印第安人劳动产出的利益。
在对待印第安人的态度上，西班牙朝廷主张温和地对待印第安人。特别是为了推行天主教，发展更多的基督徒，西班牙朝廷还常常下令要求殖民者善待印第安人，并引导他们皈依天主教，成为天主的信徒和西班牙国王的臣民。
比如西班牙双王在1493年5月29日写给哥伦布的敕令上就严词强调道：“探索航行的首要目的是改变印第安人的信仰，探险者们必须极其善意并充满爱心地对待印第安人，促进印第安人与西班牙人之间的友好关系，我们将惩罚任何虐待印第安人的人。”
但西班牙殖民者则对更改印第安人的信仰没有任何动力，他们只对压榨剥削印第安人的劳动成果有兴趣。而且，如果印第安人改信天主教，变成了基督徒，那么按照基督徒不能奴役基督徒和上帝面前人
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