胡鼎文又犯下了自己的第二个指挥错误，在已经处于下风逆水的情况下，竟然还命令船队掉头反冲锋，仍然还带着一部分风帆船只想来和吴军蒸汽炮船打近舷战。徐来见了大笑，果断命令船队向右转舵一定角度，一边引诱仍然带着部分小船的太平军船队继续拉长战线，一边先以大口径的船首炮集中轰击太平军旗舰，然后再以数量众多的舷炮慢慢割肉。
炮声连绵，汽笛刺耳，蒸汽锅炉的轰鸣声响彻湖面，七条蒸汽炮船和数之不尽的大小风帆战船在宽阔的鄱阳湖上你追我赶，左冲右突，不断开炮开枪对射，厮杀得不可开交，激战的惨烈程度比之上陆上战场都有过之而不及。
水战的技术含量远比陆战为高，越是到了这样的程度，吴军水师的指挥优势就越是体现了出来，在成功拉散了太平军的队形之后，在徐来的巧妙指挥下，吴军蒸汽炮船不但丝毫没有暴露此前受创影响到了船速的弱点，相反还借助水流和方向之利，反过来在激战中占据了机动上风，同时经过训练的吴军水师将士也在炮战中保持了远比太平军为高的命中率，持续不断的重点轰击太平军旗舰，积少成多的逐渐重创了太平军旗舰。
野路子出身的胡鼎文则在激战期间逐渐把自己没有接受过专业训练的弱点完全暴露，一直认定自军的蒸汽炮船要少一条不想和吴军水师打远程炮战，死抱着想打近舷战的心思一直带着小船作战，自行放弃了船体完好速度可以全开的优势，在激战中始终被动挨打，被吴军炮火象蚂蚁啃骨头一样的不断削弱。
结果还是到了旗舰严重受损多处起火冒烟时，胡鼎文才猛然醒悟过来，知道吴军是在玩擒贼先擒王的战术，赶紧命令自军蒸汽炮船象吴军水师效仿，同样是集中火力轰击吴军水师旗舰。可惜这么做已经太晚太晚了，太平军旗舰的船楼不但已经被吴军炮火严重破坏，还连蒸汽明轮都已经被打中了三炮，一侧失去动力，船速严重下降，不但已经追不上吴军蒸汽炮船，还变成了半飘在湖面上的活靶子。
值得一提的是，事情到了这一步，胡鼎文仍然还没有发现是自己的指挥失误导致彻底被动，错失胜机，心急如焚间竟然还怪上了石达开，嘀咕道：“翼王八千岁就是会坑人，超越小妖的水师明明比我们多一条火轮船，居然还逼着我和妖兵水师决战。”
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胡鼎文抱怨石达开瞎指挥的时候，石达开却已经在九江城下做出了明智选择——含着眼泪命令撤下攻城军队，放弃攻打九江城池，同时命令军队连夜拔营东走，准备撤回湖口保全主力
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