第二日一早，杨广便下诏，将辽东新平之地设置为辽东郡，至于原辽东郡则改名为玄菟郡。设辽州总管府，统辖辽东郡、玄菟郡、燕郡三郡军事。
杨广没有留下李景镇守辽东，在他看来，虽然李景资历更高，但也容易在辽东割据。而且将李景留在辽东，等到黄明远回来之后，反而容易与黄明远争权。
杨广以黄明祯为检校右御卫大将军，辽州总管，镇守辽东之地，表示了对黄明远的充分信任。而黄明祯年轻，威望不足，也很难在辽东进行割据。
杨广又以观王杨德雄三子通事舍人杨续为燕郡太守，以崔弘升的五弟左监门郎将崔弘寿为玄菟郡太守，迁达奚暠为辽东郡太守。杨续、崔弘寿三人不是皇亲国戚，就是功勋之后，如此安排既保证了三郡的政令通达，又使得三人因为身份，不可能叛乱。
又设副总管一名，以杨广昔日旧将史祥担任。
史祥昔日是杨广心腹，只是后来为杨广所厌恶，只担任左骁卫将军，比隋文帝时还低。及辽东之役，史祥奉命出蹋顿道，不利而还，由是除名为民。这一次若不是走通了虞世基的路子，还不能复职。
不过辽东之兵，尽是黄明远所统帅，史祥在黄明祯这里，也就只剩下一个资格老了。
辽州总管府特设与幽州同级，因此置四名虎贲郎将。黄明远倒是不藏私，以黄明溥、李进、刘黑闼、高聂四人任之，除了堂弟黄明溥，都是他丰州的旧部。现在利益争夺已经到了刺刀见红的时候，也顾不得其它了，辽东要保持稳定，势必要控制全部军队。
对于北面的胡人，杨广虽然并不在意，但还是听从了黄明远的建议。黄明远信誓旦旦，这种时候，自然得听。
因此以薛世雄调任代州总管，李景兼任平州总管，郑言庆继续担任丰州总管，王仁恭继续担任朔州总管，邓暠则继续担任营州总管。
其余随黄明远征讨辽东之人，也各有奖赏。虽然杨广很想赖了此事，但黄明远却言，若要平叛，还需要各军奋勇争先，此时切不可给杨玄感拉拢诸将军之机。
杨广只得同意。
五月十三日，黄明祯也赶到了辽东城。
他率四万主力奉命东进木底城，已经破之，兵锋直指国内城。后来黄明远急信，黄明祯这才赶紧撤回了木底城。
黄明祯所部一路东进，直到木底城下。木底城守军根本没有防备姜以式败的这么快，且城中兵力也没有多少，因此不备之下，被黄明祯所趁，抢占了城池。
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