黄明离也很清楚当初来护儿是怎么被赶出平壤城的，因此下令各部，不得掳掠，不得奸淫，凡违令者，一律处斩。又命各部士兵分街道维持秩序，清理残兵和趁乱打劫的地痞无赖。大街上有浑水摸鱼的无赖、匪徒，也尽皆处死。
经过黄明离有序的布置，数万隋军分秩序的接管全城。而沿途骑兵等各部则向内城进发。
也有一些小股的高句丽部队或者是百姓队伍试图负隅顽抗，向隋军发起攻击，但几乎不成势，被隋军杀得七零八落，很快溃散。
内城的隋军也在席玭和周法尚的围攻下，纷纷向皇宫溃败。隋军先是占领了武库，接着占领了粮仓，彻底断绝了高句丽人反击的本钱。接着周法尚率部接管对皇宫的进攻，令席玭率领大部骑兵开始在内城清理残敌。
隋军有条不紊的攻击，不给高句丽人任何的机会，确保了没有奇迹的产生。
高元下令投降的命令传遍了南门守军，这座王宫的门户终于挂上了白旗，然后缓缓打开了正门。