上机学院的学生信息，很快找到了那个少女的信息。
“布束砥信，高中三年级学生，十七岁，幼年时便在生物精神医学领域锋芒毕露，在山下大学附属医院以及樋口制药·第七医药学研究中心···”看到这里，御坂美琴已经有些相信布束砥信的话语了，当初御坂美琴交出DNA图谱的时候，就是在山下大学附属医院。
看完布束砥信信息后，御坂美琴下定决心潜入樋口制药·第七医药学研究中心探查。
在一处商店买好便装之后，御坂美琴随意找了一家酒店，换好衣服后来到了樋口制药·第七医药学研究中心，然后利用自己的能力潜入了最机密区域，发现了这样一份报告。
“超电磁炮量产计划：【Sisters】最终报告书。”
看完之后，御坂美琴顿时感到一阵轻松，自己的克隆实验确实存在没错，而且当初自己的DNA一开始就是被骗去做克隆实验的，但是，经过【树状图设计者】的计算这项计划有致命缺陷，已经终止并永久冻结了。
“什么嘛，到头来还是没有我的克隆体嘛，一定是这个疯狂的计划泄漏出来的时候就不完整，传闻不胫而走罢了。”御坂美琴像是放下了包袱了一样轻松地离开了，却是没有想到，仅仅在她离开后不久，一个和她长得一样的人就走了过来，将关于【Sisters】的档案完全删除。
而少女自称御坂。
另一边，佐天泪子来到了属于暗部Protect的基地，在这里，她见到了之前听过的春上衿衣的老师木山春生，有固法美伟的男友也是曾经大蜘蛛首领的黑妻绵流，自己的同居者，也是学院都市Level5心理掌握的食蜂操祈，还有一位不认识的美少女。
然后，在这群人之后，是自己的男友，亦是学院都市Level5的白井月。
“泪子，我现在要和你说的是关于存在于这个世界的真实，这个学院都市的真正面目，还有我的真正面目。”白井月顿了一下，接着说着。“听完我说完后，你再好好决定是否真的要到‘这边’来。”
“这个世界分成四个部分：其中普通人的世界是一部分，他们没有任何异常的能力，只是生活在这个世界上；第二部分是【科学侧】，没错，就是以学院都市为代表的超能力者以及以科学为名的武装集团；第三部分则是【魔法侧】。”
“魔法？真的有那种东西？”
“有的，既然超能力存在那么为什么魔法不存在？而且魔法的势力远远比超能力更
…。。