旨意中说魏忠贤“将素畜亡命之徒，身带凶刃，不胜其数，环拥随护，势若叛然”为由，下令将其逮捕至京。
听到这个消息，魏忠贤面如死灰，明白崇祯皇帝这是要自己去死，没有给他留半点余地，自己一旦回京必死无疑。
当日，魏忠贤和其党羽李朝钦两人痛饮一番后双双自缢，随着魏忠贤这么一死，天启皇帝在位时威风八面的阉党就落下了帷幕，崇祯皇帝登基才三个月不到就弄死了哥哥留给他的亲信，把这把天下对付文官集团最锋锐的刀自毁，却不知其作为埋下的帝国崩塌的隐患，而暗暗自得。
魏忠贤自杀的消息传来，崇祯皇帝立即就让人去浣衣局处死了客氏，接着下旨夺去魏良卿的宁国公爵位，再以谋反之罪名抓捕，明正典刑要杀掉魏良卿。
魏良卿被抓后还一脸茫然，他根本就不知道发生了什么事。等关进天牢，有人告诉他自己叔叔魏忠贤已经自杀，崇祯皇帝现在要对他下手，还给他扣了谋反的罪名准备砍他脑袋时，魏良卿吓得瑟瑟发抖，更是大喊冤枉。
明正典刑一日，魏良卿五花大绑被押上刑场，即将行刑时魏良卿哭喊叫嚷道：“我就是一个种地的普通农民，原本在老家呆的好好的，虽然脸朝黄土背朝天辛苦，但日子也能勉强过去。”
“因为自己叔叔魏忠贤的缘故，突然天上降下富贵，从家乡被接来了京师。在京师这些年自己没做过什么坏事啊，安安稳稳在家呆着，无非就是吃好点喝好点，又睡了几个漂亮女人罢了。何况这些富贵从来不是自己要的，而是你们硬塞给我的。”
“就拿自己这个宁国公来说吧，自己从没想过当什么国公，完全是你崇祯皇帝强行封的我。你昨天给我爵位，把我捧上天去，今天突然说我谋反？不仅夺了刚封的国公之爵，还要砍我脑袋，做人不能这样啊！要实诚啊！就算皇帝伱也要讲道理，没你这么干的，我实在是冤枉啊……！”
可再喊冤也是无济于事，魏良卿就这样被砍了脑袋。
魏良卿伏诛后，崇祯皇帝大获全胜，随着阉党的倒台一时间满朝都是称颂马屁之声，文官们评论崇祯皇帝英明神武，是大明开国以来难得的英主，更评论崇祯皇帝诛杀魏忠贤此举“不动声色，潜移默夺，非天纵英武，何以有此”。
登基不到三月，就扳倒了权势滔天的魏忠贤，大获全胜的崇祯皇帝在一阵吹捧声中洋洋得意，自觉得当皇帝似乎也没什么难的，自己天生就是当皇帝的料。
要不是自己比哥哥天启皇帝年幼几岁，兄弟
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