不过关宁军的问题也很多，首先是关宁铁骑的数量实在是太少，明面上关宁铁骑有三万人，可实际上仅仅三千骑而已，而且这三千骑中大半在吴襄的手中，另外一部分分别在祖大寿和其他将领的手中。
虽然关宁铁骑能打，可数量的不足导致关宁铁骑在战场上并不能发挥出决定性的作用，而且普通的关宁军大部分只是步兵，野战中面对来去如风的八旗精锐根本不是对手，只能依托防线驻守。
造成这个情况的原因有很多，其他的暂且不说，最大的关键就是没钱。辽东每年的军费数额巨大，大明光辽东军费开支就占了整个财政收入的大半，还往往不足。在这种情况下，关宁军能有这样的战力已算得上不错了，可偏偏崇祯皇帝登基后一意打算收复辽东，三番五次要求关宁军主动和皇太极开战，这样一来就给与了关宁军上下极大压力。
而且还有一点，那就是宁锦防线的问题，宁锦防线最早的设置是孙承宗打造的，孙承宗打造宁锦防线的目的是为了收复辽东，以城堡为据点稳扎稳打不断推进，从而压迫辽东建奴的生存空间。
当年这道防线起到了极大作用，孙承宗的战略计划也实施的不错，而且的确压得努尔哈赤透不过气来，当时的后金差一点就被弄得崩溃。
可此一时彼一时，当初的孙承宗的操作是建立在对辽东全面经济封锁，背后又有着朝廷全力支持，尤其是魏忠贤在财政方面的全力支持，这才有当时的战果。
可之后袁崇焕登上了蓟辽督师的位置，孙承宗对辽东的封锁策略遭到破坏，再加上皇太极继位后不仅通过从大明的走私获得了巨量的物资，打破了大明对当时后金的经济封锁，还通过攻打蒙古，联合科尔沁和察哈尔各部驱逐了林丹汗，从而改变了整个局面。
这时候，大明的财政也因为崇祯皇帝杀了魏忠贤的缘故发了变化，朝廷连税都收不上来，何谈满足辽东战事庞大的军费开支呢？一直以来，自崇祯登基后开始，辽东军费就严重不足，军费的不足自然也就导致了宁锦防线的无法维持，就连关宁军的战斗力也下降许多。
试想，关宁军在军费不足的情况下既要维持军队作战，还要保证防线的稳固，甚至还要收复辽东，这怎么可能做到？而且崇祯皇帝对辽东尤其关注，根本不顾实际情况令关宁军不得丢失一城一地，更不能畏敌避战，这样一来每当皇太极领兵来攻的时候，关宁军明明知道打不过，却又不敢撤退，只能硬着头皮孤军驻守最终被围，从而被各个击破。
之前祖大寿在
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