大明联合舰队的名义派使者让荷兰方面投降了，可遭到了荷兰人的明确拒绝，并且荷兰人甚至已做好了顽抗的准备，所以说明军必须还经历一次大战才行。
所以说拿下巴达维亚仅仅只是占据了对方在远东的总部，并不代表南海战事的结束。再加上巴达维亚一战的特殊原因，也不代表荷兰人就不能打。荷兰人的战斗力还是很强的，郑鸿逵试探派舰队进攻过马六甲，可问题在于马六甲不仅堡垒坚固而且地形利于敌方，哪怕郑鸿逵的实力比荷兰人强得多，可在双方初步交战接触之后发现，要想一气拿下马六甲没那么容易，假如强攻的话明军方面肯定要承受不小的伤亡，其他几个地方的荷兰人也是如此，摆出了一副要和大明死战到底的姿态。
此外就是巴达维亚的局势了，虽然明军占领了巴达维亚，可对于巴达维亚的统治并不乐观。考虑实际情况现在郑鸿逵只能对巴达维亚进行军管方式，由于巴达维亚之前不仅是荷兰人管理，还有着地方各股势力掺杂其中，其中就包括巴达维亚的商人、教会、土著和生活在当地的华人团体等等。
这么多年来，荷兰人在巴达维亚的统治都是依仗这些人进行维持的，荷兰人作为统治者，但许多实际的工作大部分是靠这些人来进行。现在大明取代了荷兰人成为这里的主人，可许多事必须也要得到他们的支持才能推行下去，而且南洋那边小国林立，民族关系复杂，荷兰人在当地经营多年早就有一套实施可行的政治框架，现在这个框架打破，新的秩序还没建立，郑鸿逵要对巴达维亚进行真正的有效统治困难重重。