吕不韦，如今嫪毐势力已被铲除，吕不韦的势力也不应该继续存在下去了。”李斯心中明白，若要自己出人头地，就必须把吕不韦赶出朝廷，一山不容二虎！这是等了多少年才等来的机会，怎么能轻易放弃。
秦王同意李斯的建议，但是他也明白，自己刚刚亲政，根基不稳，吕不韦树大根深，立刻处置吕不韦可能引起动荡，因此只是在朝会上斥责了吕不韦不能明察秋毫，防患未然，导致嫪毐叛乱的发生。
然而仅仅是斥责，便有很多人为吕不韦奔走，到秦王宫中为其说情，道相国实是有功之人，不该被训斥。前来说情的人越多，秦王对吕不韦的戒心就越重，现在足以看出吕不韦的权势有多大。秦王暗暗心惊，但表面上仍然不动声色，冷冷的看着吕不韦和他门客的表演。
嫪毐的案情查清以后，秦王下令车裂嫪毐，灭其三族！参与叛乱的卫尉竭、内史肆、佐弋竭、中大夫令齐等二十人也全部被处死，他们的首级被悬挂在咸阳城门上；嫪毐的门客，根据罪责轻重分别判刑，削除爵位迁徙蜀地的有四千多家，这个月天寒地冻，被冻死的不计其数。
对于赵太后的处置一直拖了三个月。作为秦王的生母，又是辅政的太后，她的所作所为让秦王最是恼火，可以说嫪毐的反叛是赵太后纵容的结果。
秦王下令将赵太后逐出咸阳，迁居雍城，母子永世不再相见！赵太后痛哭流涕，苦苦哀求，道：“嫪毐反叛并不是我的本意，诛杀吕不韦也是我一时冲动的选择，当我得知他要骚扰王宫时，才意识到问题的严重性，我就迅速通知你了，请大王念在母子多年情深的份上网开一面！”
秦王到现在仍然无法忍受自己的母后与人私通生子的丑事，便道：“这都是对母后冲动的惩罚，您就用下半生在雍城好好反省吧！”
赵太后被驱逐出咸阳后，很多人都来为她求情，认为秦王的做法不合人伦。秦王一是恼怒赵太后联合嫪毐陷害成蛟，陷自己于不仁，二是愤恨赵太后与嫪毐私通生下孩子，陷自己于不义，因此对前来为太后说情的人全部处死！前后杀了二十七人！秦王发布命令，道：“有再敢为太后求情者，砍掉手脚，立即处死！”
一时间，没有人再敢进谏。
这时，在秦为客卿的茅焦求见。秦王心道，莫不又是来为太后求情的？便派使者警告他，“你可知道凡是进谏关于赦免太后的人都被杀了？”
茅焦道：“臣当然知道！而且我还知道大王已经下令，再有求情的人，一概砍掉手足，立即处死！”
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