时挟持宫女淫乐，擅建天子鼓旗，有不臣之心，遂将其斩首。又收编了他手下的军队，将王莽首级连夜送到宛城。这样一来，既除去了王宪这样一个作威作福的人，又夺取了其功勋和军力。很快，王莽首级就送到了刘玄面前，刘玄一见之下，大喜过望，他没有料到，自己梦想了数年的事情，会在这一刻就这样展现在自己的面前。于是，刘玄情不自禁地叹道：“如果王莽能够再精明一点，何至于到现在的这样一个地步呢？”身边的韩夫人忙笑着说道：“那样的话，皇上的地位就难以达成了。”刘玄深觉有理，命人将王莽头颅悬挂在闹市，为天下人所观。可叹愚蠢的百姓，难以理解王莽的理想主义情怀，在王莽身首异处的时候，争着鞭打他的头颅，烹煮他的舌头。
自王莽政权倒台之后，刘玄所部义军如日中天，一路顺风顺水。十月，原来叛变王莽的刘望被更始政权奋威大将军刘信斩杀，严尤、陈茂等新朝旧臣都被杀死，更始政权趁势夺取汝南郡各县。当时在长江流域有一股由流民组织起来的十几万人的军队，四处攻城略地，李宪遂奉王莽命令前去绞杀，不久，流民军队由于缺乏有效的领导和必要的章程，被李宪击打得溃不成军，李宪闻讯王莽身死，考量之下，自立为淮南王。自此，王莽持续十六年的新朝彻底败亡。
王莽虽死，刘玄也没能坐享江山。此时有实力称王的不止他一个。
不过，全国各地都震慑于刘玄的皇帝血统和击杀王莽的威望，一致拥戴他当皇帝。这是一件千年难逢的奇迹，紊乱一团糟的庞大帝国，如果在一位雄才大略的英主手中，必然能够在短时间恢复秩序。可惜时也命也，刘玄注定是一场悲剧，他自己没有功勋，不能服众；他是被绿林系扶持而起，终难以像刘秀等人一样，独立自主地处理国家大事，反而会被群臣所制约。这些人都是山野草莽、盗寇流氓，刘玄并不能对其进行随心所欲的节制，于是，更始政权在目光短浅，任意施为之下，必将是自取灭亡。自古天下都是有德者居之，刘秀深感刘玄必不久矣，不禁仰天问道：“鼎之轻重，谁最终能够知晓？”