他知道窦太后的所作所为，并能够无所顾忌地惩处她时，刘肇也没有采取行动，而是让窦太后恩宠不减，直到她死后，依然力排众议，以“恩不忍离、义不容亏”为由，将窦太后谥为章德皇后。同时对于梁贵人、宋贵人的问题也都妥善安置。其母梁贵人被追封皇太后。此外，和帝还一直坚持以民为本、任人唯贤、注重道德教化左右，使得汉朝在他的治理下，整个国家与他的谥号“和”帝暗合，一时之间，大汉朝四海升平、海晏河清。
阴孝和与邓绥的后宫斗争
尽管和帝刘肇尽心竭力地想将国家治理好，重振刘氏伟业，但是东汉王朝的命运似乎冥冥中自由天定，逐渐走向了黑暗的深渊。
首先，是宦官的崛起。
皇帝跟外戚斗争，必须获得别人的支持。而皇帝长于深宫，无法与外边互通消息，于是宦官就成了皇帝的倚靠和助力。东汉政权的第四任皇帝刘肇最先向外戚发动攻击。在他与宦官郑众的逼迫下，外戚窦宪自杀。但是，窦氏衰落之后，郑众凭借功劳，其威势不减反增。于是自郑众开始，宦官的权力越来越大。
其次，则是班超经营多年的西域的丧失。
早在刘庄在位之时，班超便投笔从戎，跟随当时的大将军耿恭南征北战，最终靠着自己的三寸不烂之舌，带着三十六个随从，征服了西域各国。后来刘炟继位，改变国策，欲将班超调回洛阳，放弃西域，终在班超的竭诚努力之下，刘炟答应了他继续经营西域的请求。
经过多次战争，班超这位西域都护在事实上掌控了西域各国。到元和四年（公元87年），曾经帮助汉朝进攻车师的大月氏来到班超驻地，请求与汉朝给为秦晋之好。班超见汉朝此时正是国家蒙难之时，不宜与以边陲小国结亲，便拒绝了大月氏的请求。
永元二年（公元90年），心怀怨恨的大月氏便率领七万军队东越葱岭，攻打班超。多日攻取不得，大月氏只好去龟兹求救，半路遭到班超数百军士的埋伏，求救使者也命丧黄泉。大月氏首领随即向班超请罪，班超并没有追究他们的过错，便让他们得以重返故土，大月氏大惊之下，与汉朝和好如初，消息传来，窦氏兄妹也感到很高兴。
不久，龟兹、姑墨、温宿等国相继归附。又过了些时日，西域五十多个国家都归附了汉王朝，班超终于实现了立功异域的理想。
然而好景不长，毕竟西域各国之所以臣服汉朝，主要有三个方面的原因，一是汉朝政治清明、经济良好、军事强大；二是北方强大的匈奴政权的土崩
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