溺后宫，极度宠信万贵妃，内廷诸事多倚其统领。深崇信道术，大肆升授番僧。
晚年的朱见深也渐知僧道传奉官之滥，开始陆续裁汰，传旨多倚贤良内宦怀恩、覃恩，朝政平静，社会整体仍“幸称小康”，太平无事。
朱见深在位期间大力发展文化，诞生了闻名于世的成化瓷。这一时期的文化氛围较为松动，曾亲自编写《文华大训》一书，垂训子孙。
朱见深还是一个具有极高书画造诣的皇帝，除了《一团和气图》，也曾画过一幅《岁朝佳兆图》。这两幅作品和清代宫廷画家丁观鹏画的《无量寿佛图》，被民间誉为“吉祥三宝”。
成化元年正月，任命都督同知赵辅为征夷将军，总领所有总兵，征讨广西瑶族的叛乱。
三月，四-川山都掌蛮进行暴乱。
十二月，韩雍大破广--西大藤峡的瑶族叛乱者，将大藤峡改名为“断藤”。
成化三年正月，朱见深授朱永为平胡将军，和杨信一起征讨毛里孩。三月，朱见深封商辂为兵部侍郎，再次进入内阁。
成化三年九月，鉴于建州女真屡屡犯边，明廷集结五万大军以总兵官赵辅挂靖虏将军印为总指挥。左都御史、辽东总督李秉为副总指挥。兵分三路：左路出浑河、柴河越石门、土木河至分水岭；右路由鸦鹘关、喜昌口过凤凰城黑松林，摩天岭至泼猪江；主力自抚顺经薄刀山、粘鱼岭过五岭渡苏子河至古城。
成化十一年十一月，立皇子朱祐樘为皇太子。
成化十一年十二月，恢复郕王朱祁钰的帝号。
成化十二年三月，李震大破靖州地区的苗乱。五月，副都御史原杰安抚荆、襄的流民。十一月，四川都御史张瓒征讨湾溪地区的苗乱并将其攻破。十二月，朱见深设置郧阳府，设行都司卫所，以安排那里的流民。
成化十三年正月，朱见深设置西厂来加强特务机构，太监汪直担任提督。
四月，汪直将郎中武清、乐章，太医院的院判蒋宗武，张廷纲，浙江布政使刘福等人下了西厂大狱。
五月，方贤又下了西厂狱。大学士商辂、尚书项忠等人上书朱见深请求废置西厂，朱见深采纳他们的建议。
六月，罢免项忠为民，又复设西厂。不久商辂也辞官。
成化十八年正月，朱见深下旨废置西厂。
因为在位二十三年，长期不召见大臣，处决政事均经内宦。
晚年传旨多倚太监怀恩、覃吉。怀恩犯颜敢谏。覃吉曾
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