公已正式将自己提督海事太监所在本部命名为大明皇帝亲军指挥本部，简称大本营。大本营下设海军参谋本部，陆军参谋总部，各总部又下设军事作战司、通信联络司、后勤审计司、兵要地志司、文书谍报司等一系列军事机构。
根据大本营发布的“甲寅皇军二号训令”表明，联合舰队之常备舰队、警备舰队；陆军之甲等师团、乙等师团完全归于亲军指挥本部统一指挥。
联合舰队司令长官人选暂时空出，皇家海军之常备舰队由总兵官王大力担任，接魏公公令后，王大力立时组织海军上下检修战船，补充淡水、粮食，随时做好升帆远航准备。
陆军方面，郑铎率领第一旅团三个联队随海军前往福建中左所，为近卫师团主力开拔做准备。
当日，魏公公亲率陆海两军将领往码头送行，赋诗曰：“赤壁一战乾坤转，东风送我第一船！”
皇明兴废，在此一举。