此后，便是德川幕府主导的镇压天主教运导，继而引发了日本天主教倒幕运动，又戏剧性的让汉人颜思齐成了日本的倒幕英雄。再之后，便是紫袍加身的庞麦臣阁下亲手主导的天主教讨日战争了。
征服日本，军事上的征服是一方面，文化和宗教的征服更是一方面。
具有高度政治智慧的魏公公在具体听取那几个在日本天主教有影响力的信徒和教士的汇报后，总结了几个矛盾点。
第一点就是教义的矛盾。
天主教义坚持上帝是最高权威，上帝面前人人平等，这和以将军为最高主宰、严分身份等级的幕藩体制完全不同，且完全抵触。
第二点就是天主教的排它性，天主教否定神佛信仰，认为上帝是天地万物之主，应该服从上帝，而不应该服从父母、主人、君主。
这对自称“神国”的日本和被尊为“天照大神化身”的德川统治者来说，更不能容忍。
此外，天主教反对日本武士的切腹、多妻制，都直接和日本统治阶级的传统对立。
这些矛盾点结合在一起，哪怕没有新教基督国英国、荷兰商人对西班牙、葡萄牙旧教天主教士的中伤，日本政府也绝不会允许天主教在日本继续发展。
便是放在大明，哪怕魏公公是庞麦臣大主教，他也不可能让天主教的旧教义在中国传播。
所以，改良天主教义，坚持中国化道路，否定天主教的排它性，将上帝与东方文明神话结合在一起，才能让天主教真正的为公公所用。
去年公公在北京南堂召开的中国化道路工作会议中，就教义改革公公曾经提出若干点。
“东风一定要压倒西风！”
“人口数量占据第一的皇明一定要在宗教领域盖过人口较少的族群。”
“和西方的交道过程中，我们必须清醒认识到天主教、基督教乃至各大教派于西方各国人民的影响，信仰这个东西我们不去争取，不去控制，不去把握，我们的敌人就会加以利用。”
正在编缉的《魏公文选》第六卷中有关宗教部分就引用了魏公的几次讲话。
私下里，魏公公更是毫不避讳的和郭居静等人提出，东方教区现在及未来唯一的奋斗目标就是将天主教世界的领导权接管过来。
“如果我们的教区面积最大，如果我们的信徒人数最多，如果我们的圣斗士们最强，为什么我们还要听从梵蒂冈的命令？”
“教宗、教皇又为什么一定要由西方人担任？难道
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