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伴随着追逐战完成后，还来不及感叹的PDD，就进入了一长串的剧情。
艾吉奥回到府邸却突闻自家老爹被卷入了一场政变之中，被抓到了监狱内。
躲过值班的守卫，再次见到自己老爹的艾吉奥被告知，自家底下的密室之中有能够澄清奥迪托雷家族无罪的证明，只要将这份证明交给老爹在城内担任法官一职的密友，即可洗脱冤屈。
艾吉奥照做，并在密室中获得了一套刺杀服与一把破损的袖剑，也正是玩家们在开场插图之中所看见的那一身帅气的装束。
只不过令艾吉奥并没预料到的是。
法官密友早已被另一股隶属于圣殿骑士的势力所收买，背叛了自己的父亲。
并且在次日当街，在混入人群准备施展援救的艾吉奥面前，亲手绞死了艾吉奥的父亲，以及艾吉奥的两个兄弟，
还下令对整个奥迪托雷家族以叛国罪进行全城通缉。
原本不可一世的纨绔子弟艾吉奥，瞬间从天堂坠入地狱，自己的亲人死亡也给他带来了巨大打击，甚至自己的性命都危在旦夕。
好在此时家中一名女仆出手相救，帮助艾吉奥与他的母亲以及妹妹逃离府邸，躲到了由女仆的姐姐葆菈所开的妓院中，捡回一命。
葆菈对艾吉奥隐瞒了自己也是刺客组织一员的事实，但还是尽心尽力地教他如何在城市中隐蔽地行动，不被发现。
她还让艾吉奥去找莱奥纳多·达芬奇修好了袖剑，并教会了他刺杀的技能。
PDD根据提示指引，经过了几番熟练之后，顿时对‘刺杀’这种新颖的设定大感兴趣。
“芽儿，不需要正面交战，只要不被人发现的情况下，冲上去给他一刀就能直接秒杀！”
“有点爽的啊！”
“而且还可以借助人群打掩护，你们看，我混进人群的时候，整个人群小队伍的颜色都会变成灰白色，看起来就好像十分不起眼一样。”
“这时候如果从旁边来了一名敌方士兵……”说话间，PDD直接伸手将路过的一名士兵揽入怀中，并且手起刀落。
如果放在正常情况下，这样在大街上招摇过市的杀人，势必会引发市民的恐慌以及周围巡逻士兵的戒备。
但在潜行状态下，却能不引起任何人注意就带走想要暗杀的目标人性命。
除了隐入人群之中，还能通过城市内的一系列钻草垛、坐在长椅上休息，等各种能够掩人耳目
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