对于那些离开的幸存者，联盟的人并没有阻止，反正再怎么走也不可能五十万的幸存者都走掉，就算是走掉了一半，对联盟来说，也没有太大的影响，他们自己人加在一起就有十万了，其中进化者和觉醒者有一万，其他九万虽然也有异化现象，但是在大量晶核和变异兽肉的供应下，他们的异化速度大大延缓了，联盟的首领们打算用半年多的时间来跟希望基地兑换足够多的基因药剂，把剩下九万普通人全部都变成进化者，这样一来，他们不仅可以解决掉异化现象危机，还能让自己的势力增强。
联盟的那些势力也并不是放任不管，如果他们真的这样做的话，第一二层很快就会陷入无秩序的状态，到时候不用多久，人就会自相残杀殆尽了，这也不是他们想要看到的，他们只是想要知道完全异化后，幸存者会不会跟变异怪物失去理智，没有失去理智的话，他们就可以打开封闭的大门，重新统治幸存者，不过结果是失去理智，变成了变异怪物一样存在的话，他们自然就不会再管他们了。
可以说，联盟的首领们算盘打得很好，留下一支武装力量在第一二层维持秩序，一旦发生他们预想中最不好的结果，这支留下来的武装力量就算是全部牺牲了，他们也不会心疼的。
只不过事情的发展出乎联盟那些首领的预料之外，在官方车队还没有离开几天时间，第一二层就开始出现了混乱，已经有异化的比较严重的人失去了理智，他们会疯狂地攻击人类，把杀死的人类吃掉，跟变异怪物差不多，只不过比起奇形怪状的变异怪物，这些异化失去理智的人还能保持一部分人类的特征。
对待这些失去理智的人，联盟直接下令武装人员全部杀死，一个不留，只是这些异化人实力比起一般的进化者要强大，跟变异怪物相比只有一个区别，那就是这些异化人受伤打不过时会逃走，就像是野兽遇到强敌首先想到的就是逃跑，这也让联盟的武装力量清理起来不是那么顺利，毕竟首都基地第一层加上第二层，想要找出躲起来的异化人，就算是有十万人也不够看的。
很多时候，这些异化人还会偷袭他们，联盟没有什么好办法，只能发动其他幸存者去寻找这些异化人，不过效果并不好，那些幸存者都知道完全异化会导致什么后果了，每个人都有种大难临头的感觉，他们每个人都想着怎么解决或者延缓身上异化的情况，怎么可能还有心思帮联盟的忙呢。
其实五十万人当中，大部分异化现象还没有到达失去理智的那种程度，他们只要不是傻子，都猜到了联盟为什么在官方
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