西伯利亚，北冰洋某处，伯大尼基地中。
在巨大而复杂的组装工厂内，数台吊装机器正在小心翼翼地培养槽中完成躯干、头部、两条手臂、牙齿骨骼、两颗眼球培育的EVA缓缓取出。
本来按照常规型号的EVA全生产流程来说，5号机优先制作的部分肯定是脊椎、躯干、四肢，但由於不同项目之间的资源竞争，所以现在只能做到这种程度。
但除了青子之外的所有人都不知道的是，「原时空」的EVA五号机，不但要在初具人形的人棍状态就被拉出来打「逃跑」的第三使徒，而且还被源渡派来的间谍在机体内部安装了自爆装置，同基本上改造完成的第三使徒同归於尽。
但青子等人不想要看到这种局面，或者说苍崎姐妹盯上这台「计划之外」的五号机已经很久了，橙子对此志在必得。
所以在她的斡旋之下，第三使徒的改造资源被部分挪用到了EVA五号机身上，才给了原本人棍的五号机培育了双臂和眼球。
除此之外，青子通过对NERV本部MAGI系统的控制权掌握，暗中获取了法国支部JA项目的工程进度，并了解到了法国支部内部正在陷入了争执的情报。
没错，法国支部开始内斗了，而且原因也非常简单，那就是资源争夺。
由於式波系列的「分布式培养」结果（青子对明日香02的干扰），EVA
二号机最终被委员会决定从柏林转移到巴黎继续建造。
巴黎原本的研究项目是完全抛弃生物兵器概念的JA系列人形机甲，其内置了可以半永久运行的N2反应炉，除了不能产生AT力场之外，看起来几乎完全吊打了常规EVA的各种参数。
但EVA二号机的突然转移，彻底改变了法国支部高层的立场，原本被当做是「亲儿子」集中资源开发的JA机甲项目彻底陷入了停摆，几乎把所有的资源全都转移到了对二号机的「本地化改造」上。
这就导致了JA装甲成为了法国支部的巨大负担，因为这一系列机甲装备光是维护费用就是个天文数字，在拥有二号机的情况下，法国支部根本就没有那个闲心继续发展JA装甲了。
这个时候，伯大尼支部就「恰巧」跳了出来，而且有非常合理的理由去接收法国支部「食之无味、弃之可惜」的JA装甲，或者说法国支部听说这个消息之後简直是迫不及待地自费把JA系列装备全都运抵了伯大尼基地。
橙子满意地看着「生来残疾」的五号机素体，
…。。