照原本历史上发展，他回乡之后，最终投靠了建虏，并又带人返回山东青州。这个时候，青州已经被李自成部将赵应元以假降之计杀了建虏所派户部侍郎王鳌永。
于是，李士元带领数人入城，假意要与赵应元联合抗虏。赵应元亦仰慕李士元的名声，未加防备，被李士元所杀。青州城再次易主，不过没有发生战事。
之后，李士元没有做官，遁迹故里。此后二十年，有人看到李士元经商为生，做起贩卖马匹的生意。
李士元三全青州城的事迹非常突出，影响很大，青州城北门内建有李将军祠。
过了一会儿之后，就见李士元叹了口气，然后看向崇祯皇帝说道：“如之奈何？某能如何？某空有一腔报国之心，却是报国无门，还能如何？只能走一步看一步，随波逐流罢了。”
带着一些感慨，说完这些话之后，他又有点好奇地问崇祯皇帝道：“不知阁下是何人？”
说真的，他实在是有点奇怪，因为从眼前这人的谈吐上，他可以断定，这绝对不是普通人，甚至可以说，绝对不是一般的达官贵人。
他一度怀疑眼前这人说不定是皇室宗亲，但是他又想不出来，有哪个皇室宗亲有眼前这人的气度。
崇祯皇帝听到他又一次问自己的身份，便看着他认真的说道：“我现在可以放你离去，但是你要是知道了我的身份的话，就只能跟着我了。”
说到这里，他盯着李士元，一字一句的问道：“伱还想知道我的身份吗？”
李士元听到他的这些话，特别是听到他说要放自己离去时，这个人身边的那些人的反应，似乎很是有点担心的样子，他便知道，这个人的身份绝对非同凡响。
他没有立刻回答，只是看了崇祯皇帝一会，忽然表情肃然，对崇祯皇帝说道：“阁下就不怕某知道阁下身份之后，假装顺从跟随，但是回头就跑了么？”
崇祯皇帝听到这话，却是自信一笑，并没有开口回答这个问题。
李士元见此，便也没有再多说，只是简短说道：“还请阁下告知！”
崇祯皇帝听了，露出了一丝微笑说道：“朕才是真正的大明皇帝，京师城破半月之后出城，组建了太平军，如今要前去登州府以为根基，重新打天下，还天下一个太平！”
一听这话，李士元顿时露出不可思议表情，瞪大了眼睛看着眼前这人。
说真的，他是下意识地觉得不相信！
不相信眼前这人会是崇祯皇帝，不相信皇
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