胜万松的最后一名使徒「服部忍者」率领「忍者六骑士」，揭起了对抗怒者的反旗，在惨烈的战争以后，忍者之祖被打倒。
“忍者们用空手道统治了平安时代，但平安时代并不平安——忍者大战忍者，忍者统治凡人，凡人反抗忍者，凡人对抗凡人…之后的历史就像你知道的一样，工业革命爆发，两次的世界大战爆发，太空探索因为Y2K事件与电子战争而停顿，但…”
贾基没有继续说下去，而小季却是接过了他的话头，忍不住出声——
“但忍者并没有消失，只不过是「离开了表面的舞台」。”
在有如浸泡在流水里的奇妙时间感觉中，她——矢本·小季，居然就这样听着那个从异世界来的男人，讲述完了如此不可思议的事情…而她的心情，此时一点也不害怕，反而意外的平静。
“哈啾！”
少女突然打了个可爱的喷嚏。
她紧了紧身上穿着的加厚校服，觉得今年的冬天有些格外…冷。
因为，可怕的、凶残的忍者可能就潜伏在她的周边！！