期限为九十九年；石见银山、生野银山明日合办的矿场开发五十年，附近矿山不准矿场以外的人开采，得到的银子由大明、日本皇室和当地的大名按照四四二的比例分配；所有日本的沿海港湾、岛屿概不租借或让给他国；日本国聘用大明人为政治、军事、财政等顾问；大明帝国帮助日本天皇建立一支直属武装力量等
新的《明日下关条约》有主要条约二十一条，附属条约四十二条。通过这些条约，大明控制了日本的军事、领土、财政等要害。就在政仁陶醉在福寿膏带来的飘飘欲仙的快感和天皇重整皇权的美梦中时，殊不知日本已经在不知不觉中沦为了大明的属国