先进入京都市区的特别机动大队第3中队对市区东部进行了侦察，发现了数个幸存者定居点（其中一个定居点外部署了许多防御设施），但没有发现大阪警察部队的踪迹。认为京都市区还算安全的特里同等人于是催促中村清次郎和春日秋水所部尽快穿过比叡山，但兴奋过头的众人似乎忘记了他们携带的广播设备只能保证变异生物不会直接出现在他们身旁而不是创造一片哪怕在设备远离后仍是变异生物禁地的安全区。结果，放心大胆地带着被士兵们连哄带骗地劝往京都的大批难民穿过比叡山的第1中队和第2中队在山间遭到了以猫科动物为主的变异生物群体突然袭击，当即有70余名士兵在袭击中丧生，幸存者的伤亡则还要更高一些。
见四面八方都是敌人，中村清次郎连忙率领部队和平民向距离战场最近的寺庙撤退。那附近的视野相对开阔一些，以寺庙建筑为掩体的特别机动大队士兵也不必担心被空中火力支援误伤。与此同时，正按长间晋三的命令接管大津市幸存者定居点的日曜会民兵得知特别机动大队被围困在比叡山上，连忙和从京都市区折返的第3中队从左右两侧同时出击、协助老格兰杰和吉尔斯突破变异生物组成的包围圈。经过持续三天的血战，特里同所部总算在包围圈西北方向撕开了一个口子，夺路而逃的特别机动大队地面部队顺势从这里涌出、慌不择路地闯入了京都市区东北部。
如果阿杰姆贝没有及时地率领他的部队赶到战场附近，穷追不舍地继续追捕猎物的天启病毒变异生物毫无疑问将会进攻京都或大津市——又或者是双管齐下——届时后果不堪设想。巧合的是，半兽人集团雇佣兵们刚抵达大津市就遇见了从比叡山撤退的日曜会民兵。了解了战斗的具体经过后，阿杰姆贝连忙命人在市区内部署音波屏障枢纽，同时还派遣无人机运输设备前往山上的寺庙、让仍被变异生物包围的幸存者协助山下的支援部队部署这些装置。在此期间，有些从山上冲下的变异生物试图对阿杰姆贝所部发动进攻，它们理所应当地成为了阿杰姆贝检验用车辆改装成的自行火炮命中率的最好靶子。
“这里到处都是些民用载具改装而来的军用装备，我们看到的只是一小部分罢了。”连日来为被困的特别机动大队主力提供支援的吉尔斯总算可以松一口气了。他不喜欢这样的战场，过去没有哪个飞行员在执行任务期间还要时刻防备下一秒就可能直接出现在座驾附近的飞行变异生物，而这样荒谬的现状却是他无论如何也逃不开的。“我原本以为麦克尼尔千辛万苦找来的这些士兵只用一天时间就能突围，看
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