如此大胆，敢在朝堂上揭露他的罪行。他连忙上前，说道：“陛下，这是萧琰污蔑老奴，这些证据都是他伪造的。请陛下明察。” 新帝李新宇看了看魏忠贤，又看了看证据，心中犹豫不决。他知道魏忠贤在朝堂上的势力很大，若轻易相信萧琰的话，可能会引起朝堂的动荡。但这些证据又让他不得不怀疑魏忠贤的所作所为。
就在新帝李新宇犹豫不决的时候，萧琰说道：“陛下，这些证据都是臣亲自调查搜集而来，绝无半点虚假。魏忠贤在朝堂上为非作歹，早已引起民愤。若陛下不及时惩治他，恐怕会危及江山社稷。” 魏忠贤听了萧琰的话，心中大怒。他指着萧琰，说道：“你这狂徒，竟敢污蔑老奴。陛下，老奴对陛下忠心耿耿，绝无二心。请陛下为老奴做主。”
新帝李新宇沉思片刻，说道：“此事事关重大，朕需要仔细调查。萧琰，魏忠贤，你们二人暂且退下，待朕查明真相后再做定夺。” 萧琰和魏忠贤听了新帝李新宇的话，都退了下去。魏忠贤心中明白，此次若不能摆脱嫌疑，自己必将身败名裂。他决定先下手为强，除掉萧琰。
萧琰回到住处后，知道自己已经处于危险之中。他知道魏忠贤不会放过他，必须想办法应对。正在他思考之际，突然听到门外传来一阵嘈杂的声音。他心中一惊，连忙起身查看。只见一群黑衣人手持利刃，冲进了他的房间。为首的一人正是魏忠贤的心腹。
黑衣人将萧琰团团围住，为首的人冷笑道：“萧琰，你这不知死活的东西，竟敢与我们魏公公作对。今天就是你的死期。” 萧琰心中暗自叫苦，但他并不畏惧。他说道：“你们这些奸贼，多行不义必自毙。今日就算我死了，也会有人为我报仇的。” 说着，他拿起身边的一把椅子，准备与黑衣人搏斗。
黑衣人见状，一拥而上。萧琰虽然奋力抵抗，但终究寡不敌众。他身上多处受伤，渐渐体力不支。就在他快要支撑不住的时候，突然听到外面传来一阵喊杀声。原来是杨涟得知萧琰有危险，带着东林党的人赶来了。黑衣人见势不妙，纷纷逃窜。杨涟等人冲进房间，将萧琰救了下来。