需妥善安置未染疫之民，供应米粮药物，以免生乱。京师九门，当加强盘查，既防疫病流出，也防……奸人混入。” 他也想到了人为的可能。“此外，当立即以朝廷名义，明发安民告示，陈说疫情，公布官府举措，辟除谣言，稳定民心。可令顺天府、大兴、宛平两县，组织人手，于各坊间宣讲，发放避疫药散，安抚百姓。”
徐阶捋着胡须，缓缓点头：“叔大所言甚是。救治、隔离、安民、查源，四管齐下。然此疫非同小可，仅靠顺天府、太医院，恐力有未逮。老臣建议，殿下可下旨，命京营抽调兵丁，协助顺天府封锁、巡查疫区；命户部即刻调拨钱粮药材，供应疫区及全城防疫所需；命礼部、钦天监……” 他顿了顿，看了一眼太子脸色，继续道，“或可设坛祈禳，以安民心？”
“设坛祈禳就不必了！” 朱载垕断然否决，语气冷峻，“父皇前诏方罢斋醮，孤岂可再行此虚妄之事？民心之安，在于实事，不在虚文！传孤旨意：”
他霍然起身，一连串的命令清晰吐出：
“第一，即日起，京师成立防疫总署，由高拱总领，太医院、顺天府、五城兵马司、户部、工部派员协理，专司此次瘟疫防治一切事宜！有权调动京营兵丁、调用府库钱粮药材，凡有防疫所需，各衙署不得推诿延误，违者严惩！”
“第二，太医院全体医官，分作三班，昼夜不停，全力诊治，探究病源药方。着太医院院使亲自进驻南城疫区，主持救治！所需药材，由户部及内承运库优先拨付，可向京城各大药行征调，按市价给付，敢有囤积居奇、哄抬药价者，立斩不赦！”
“第三，顺天府、五城兵马司，协同京营，按疫区轻重，分片隔离。已染疫者，集中救治；未染疫者，严控出入，每日由官府供给米粮菜蔬，定时巡查。所有死者，一律火化，深埋。疫区污水、垃圾，由工部派人专门处理，石灰铺撒，务必洁净。”
“第四，以孤之名义，明发安民告示，详陈疫情及官府举措，承诺官府绝不放弃任何百姓，必全力救治，安定人心。命都察院、五城巡城御史，严查散布谣言、扰乱市价、趁疫作乱者，一经发现，就地正法！”
“第五，” 朱载垕目光如电，看向陆炳和黄锦，“东厂、锦衣卫，全力稽查此次瘟疫源头！着顺天府、大兴、宛平两县，详查南城一带近日有无可疑人物出入，有无异常物品投放，尤其注意水源！陆炳，黄锦，你二人亲自督办此事，若有蛛丝马迹，立刻报孤！孤怀疑，此疫来得蹊跷！”
“臣等
…。。