忡忡。全琮觉得，时下关羽主力远离荆州，东吴完全可以乘此机会，出兵夺回荆州，便上奏孙权。当时孙权已与吕蒙议妥暗袭荆州之计，收到全琮的奏折后，唯恐事泄，因此对全琮之奏置之不理，但内心却是欣赏全琮的军事才能。关羽战败并被枭首后，孙权大摆庆功宴于荆州辖下公安，席间他对全琮道："你之前上奏的那件事，我虽然没有及时回应你，但我一直记着，今天的成功，有着你的一份功劳啊。"此次欢宴毕，孙权即封全琮为阳华亭侯。
公元222年，代汉称帝的魏文帝曹丕，为了提升自己服众的份量，不听老臣、谋士贾诩之劝，兴兵伐吴。孙权令吕范督领徐盛、全琼、孙韶等将领率舟军前去拒敌。其时江面风烈浪大，东吴舟军难以控制，漂到长江北岸，遭到魏军攻击，东吴船只相继倾履，士卒战死、坠水而亡数以千计，东吴军队只得撤军退守。退守期间，全琮与徐盛联手，袭击魏军臧霸之军，诛杀魏将尹卢，为东吴挽回了一点面子。孙权迁全琮为绥南将军，进封钱唐侯。三年后，孙权又使全琮假节，领九江太守。
公元229年，孙权称帝，大封群臣。全琮被迁升为卫将军、左护军、徐州牧，并娶孙权长女、因丈夫周循（周瑜之子）去世守寡的孙鲁班为妻。
这年初冬，孙权出于扬威逞强，令太子孙登率军出征魏国，等到大军到达安乐，孙权方才宣布此举。群臣听罢，无不惊骇，但无一人敢予劝谏。
全琮深为忧虑此举，于是密奏孙权："自古以来太子未尚偏征，从队时称为抚军，防守时称为监国。如今在无君皇亲征的情况下，让太子单独率军东出，显己违背古制，此举很是不妥。"孙权思考后，认同全琮之奏，即命孙登回军。从此群臣多赞全琮有大臣之节。
自此之后，全琮又在征伐六安、进军新城、决胜芍陂等战役中，有胜有败，有功有过，但总体而言，凭着附马身份，孙权对他一直加官进爵。
俗话说，一人得道，鸡犬升天。基于全琮曾任大都督、迁右大司马、左军师等职，他的家族子弟自然跟着享受宠幸荣贵。虽然全琮位高权重，但他一如既往保持本色，谦虚地接待士人，同情地资助弱者，故口碑一直不错。
公元249年，全琮逝世，其子全怿嗣爵。公元257年，魏将诸葛诞因不满司马昭擅政，起兵寿春，反叛司马昭，并请求东吴相助。时为吴少帝的孙亮，屈承权臣孙綝主意，遣派全怿引军援救诸葛诞。全怿因恨孙綝嗜杀无道，加上诸葛诞已陷死局，便出城降魏，魏国授其为平东将军，封临湘
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