水师建立以来，陆军和海军一直在争夺内河水师的统辖权，为此纠缠了很长时间。
从组成上来看，内河水师的大部分舰船都是海军舰队淘汰下来的老旧小船，水兵和军官也多来自于海军系统，他们对海军依然有着一定的向心力和归属感。
然而，从战略功能上来看，内河水师又偏向陆军，主要负责协助陆军完成登陆或运输任务，和海军关系不大。
最后，皇帝对双方的争吵感到厌倦，大笔一挥，将内河水师划归自己直辖，战时指挥权则交予陆军指挥官。
七年的时间里，内河水师主要在多瑙河下游活动，也没有参与什么战争任务，平时为商船队提供一些保护，打击一下瓦拉几亚人的偷渡小船，为射击军和皇家骑警运输物资……也就这些。
当然，这只是因为帝国北部没有战争，并不代表内河水师没有价值。
实际上，东罗马帝国在保加利亚的道路体系和驿站体系主要有三条，分别是从君士坦丁堡向北连接康斯坦察城的皇帝大道，从君士坦丁堡向西北连接阿德里安堡和普罗夫迪夫的黑铁大道和从布尔加斯城向西连接玫瑰谷和索菲亚城的玫瑰大道，都是一级道路，路况良好。
整个多瑙河下游平原暂时还没有自西到东的一级道路，维丁大区和康斯坦察军区的商业沟通主要就通过这条蓝色多瑙河。
皇帝为了控制维丁城以东的多瑙河河道，曾在沿岸修建了三座大型炮台，兼具收税功能，每座炮台足以覆盖半个河面，剩下的半个河面就要依靠内河水师的封锁和堵截了。
多瑙河连通了很多国家，自古便是商业繁忙之河，来自上游各国的商品可以顺流航行，从黑海直抵君士坦丁堡，东罗马帝国的商品也可以从这里一路抵达贝尔格莱德，布达佩斯，维也纳甚至是慕尼黑。
当然，在正常情况下，从下游往上游运商品的船只最多走到布达佩斯，多瑙河上游的水势比较湍急，航速太慢，成本太高，不值得。
实际上，在多瑙河航运中，商人们往往会出现“阶梯分工”现象，维也纳的船队把货物运往布达佩斯就返航了，布达佩斯的船队将货物运往贝尔格莱德，贝尔格莱德的船商再继续往下运。
这是一个非常了不得的商机，东罗马帝国也很快利用了起来，一些商队开始专门负责多瑙河下游航运，将君士坦丁堡的商品装船驶入多瑙河，在维丁城卸货，交给其他商人。
维丁港是东罗马内河水师的母港，维丁炮台是东罗马帝国在多瑙河上修建炮台中
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